Thanh bên bài viết
Số lượt xem PDF: 5
XÂY DỰNG ĐỐI CHỨNG CHUẨN CHO KỸ THUẬT MULTIPLEX qPCR XÁC ĐỊNH BACTEROIDES FRAGILIS, FUSOBACTERIUM NUCLEATUM, AKKERMANSIA MUCINIPHILA VÀ ESCHERICHIA COLI Ở BỆNH NHÂN UNG THƯ ĐẠI TRỰC TRÀNG
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Mục tiêu: Xây dựng được đối chứng dương giúp phát hiện đồng thời Enterotoxigenic Bacteroides fragilis (ETBF), Fusobacterium nucleatum (Fn), Akkermansia muciniphila (Am), Escherichia coli (E.coli) với độ đặc hiệu và độ nhạy cao trong khối u sinh thiết từ bệnh nhân (BN) ung thư đại trực tràng (UTĐTT). Phương pháp nghiên cứu: Sử dụng phương pháp qPCR đa mồi, thiết kế các cặp mồi đặc hiệu với các gen của ETBF, Fn, Am, E.coli, xây dựng mẫu chuẩn và tối ưu điều kiện qPCR đa mồi. Kết quả: Tạo ra 4 plasmid tái tổ hợp cho các chủng vi khuẩn. Ngưỡng phát hiện của kỹ thuật đạt đến 10 bản sao vi khuẩn trên một phản ứng, với hệ số tương quan R2 > 0,99; hiệu suất phản ứng > 94% và có thể sử dụng làm đối chứng chuẩn để phân tích trên mẫu bệnh phẩm. Đồng thời, qua khảo sát trên 100 mẫu UTĐTT nhận thấy tỷ lệ nhiễm vi khuẩn ETBF, Fn, Am, E.coli lần lượt là 61%, 60%, 44% và 39%. Kết luận: Bước đầu cho thấy những thay đổi của hệ vi sinh vật có tiềm năng trở thành dấu ấn sinh học để phát hiện sớm UTĐTT.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
Bacteroides fragilis, Fusobacterium nucleatum, Akkermansia muciniphila, Escherichia coli, Ung thư đại trực tràng, qPCR đa mồi
Tài liệu tham khảo
2. Pandey H, Tang DWT, Wong SH, Lal D. Gut Microbiota in colorectal cancer: Biological role and therapeutic opportunities. Cancers (Basel). 2023; 15(3). DOI:10.3390/CANCERS15030866
3. Wang Q, Ye J, Fang D, et al. Multi-omic profiling reveals associations between the gut mucosal microbiome, the metabolome, and host DNA methylation associated gene expression in patients with colorectal cancer. BMC Microbiol. 2020; 20(1). DOI:10.1186/S12866-020-01762-2
4. Sender R, Fuchs S, Milo R. Revised estimates for the number of human and bacteria cells in the body. PLoS Biol. 2016; 14(8). DOI:10.1371/ JOURNAL.PBIO.1002533
5. Zhou Y, He H, Xu H, et al. Oncotarget 80794 www.impactjournals. com/oncotarget Association of oncogenic bacteria with colorectal cancer in South China. Oncotarget. 2016; 7(49):80794-80802. www.impactjournals.com/oncotarget/
6. Osman MA, Neoh H min, Ab Mutalib NS, et al. Parvimonas micra, Peptostreptococcus stomatis, Fusobacterium nucleatum and Akkermansia muciniphila as a four-bacteria biomarker panel of colorectal cancer. Sci Rep. 2021; 11(1):1-12. DOI:10.1038/s41598-021-82465-0
7. Shariati A, Razavi S, Ghaznavi-Rad E, et al. Association between colorectal cancer and Fusobacterium nucleatum and Bacteroides fragilis bacteria in Iranian patients: A preliminary study. Infect Agent Cancer. 2021; 16(1):1-10. DOI:10.1186/s13027-021-00381-4
8. Tran HNH, Thu TNH, Nguyen PH, et al. Tumour microbiomes and Fusobacterium genomics in Vietnamese colorectal cancer patients. npj Biofilms Microbiomes 2022 81. 2022; 8(1):1-13. DOI:10.1038/s41522-022-00351-7
9. Tran CT Du, Nguyen MVT, Tran MT, et al. Findings from the first colorectal cancer screening among 103 542 individuals in Vietnam with systematic review of colorectal cancer screening programs in Asia-Pacific region. Jpn J Clin Oncol. 2022; 52(7):699-707. DOI:10.1093/JJCO/ HYAC043
10. Hou Y, Zhang H, Miranda L, Lin S. Serious overestimation in quantitative pcr by circular (supercoiled) plasmid standard: Microalgal pcna as the Model Gene. PLoS One. 2010; 5(3):e9545.DOI:10.1371/JOURNAL.PONE.0009545