Thanh bên bài viết
Số lượt xem PDF: 89
XÂY DỰNG ĐƯỜNG CHUẨN ĐỂ ĐỊNH LƯỢNG NỒNG ĐỘ LONG NON-CODING RNA IFI6lnc2 VÀ EPB41L4A-AS1 BẰNG PHƯƠNG PHÁP REAL-TIME PCR
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Mục tiêu: Xây dựng đường chuẩn để định lượng nồng độ lncRNA IFI6lnc2 và EPB41L4A-AS1 bằng phương pháp real-time PCR. Phương pháp nghiên cứu: Sử dụng phương pháp real-time PCR định lượng tuyệt đối để xây dựng đường chuẩn dựa trên các mẫu chuẩn có nguồn gốc từ các plasmid tái tổ hợp chứa gen mã hóa cho lncRNA IFI6lnc2 và EPB41L4A-AS1. Kết quả: Nghiên cứu đã nhân dòng thành công plasmid pJET-IFI6lnc2 và pJET-EPB41L4A-AS1. Các plasmid tái tổ hợp thu được có nồng độ và độ tinh sạch cao (pJET-IFI6lnc2 có nồng độ 1,8 x 1010 copy/mL; pJET-EPB41L4A-AS1 có nồng độ 2,4 x 1010 copy/mL). Hàm số biểu thị cho đường chuẩn của lncRNA IFI6lnc2: Y = -3,408X + 35,989 (R2 = 0,998, E = 96,5%); với lncRNA EPB41L4A-AS1: Y = -3,4706X + 36,225 (R2 = 0,999, E = 94,0%). Kết luận: Các đường chuẩn thu được có tương quan tuyến tính và hiệu suất phản ứng tốt.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
Long non-coding RNA (LncRNA), EPB41L4A-AS1, IFI6lnc2, Đường chuẩn
Tài liệu tham khảo
2. Liu Weiwei, Ding Chan. Frontiers in cellular, microbiology infection. Roles of LncRNAs in viral infections. 2017; 7, 205.
3. Mukherjee Sumit, et al. mRNA-lncRNA Co-expression network analysis reveals the role of lncRNAs in immune dysfunction during severe SARS-CoV-2 infection. 2021; 13(3):402.
4. Zhang Yanwei, et al. LncRNA LINC02574 inhibits influenza a virus replication by positively regulating the innate immune response. 2023; 24(8):7248.
5. Shi Ting, Gao Ge, Cao Yingli. Disease markers. Long noncoding RNAs as novel biomarkers have a promising future in cancer diagnostics. 2016.
6. Lê Thị Bảo Quyên. Xây dựng quy trình định lượng nồng độ BKV-DNA bằng kỹ thuật real-time PCR và phân tích đặc điểm di truyền phân tử của virus ở bệnh nhân ghép thận. Luận văn thạc sỹ khoa học. 2020.
7. Applied Biosystems. Fast SYBR green master mix protocol. 2010.
8. Phạm Hùng Vân. Polymerase Chain Reaction - các vấn đề cơ bản. PCR và Real time PCR các vấn đề cơ bản và các áp dụng thường gặp. Nhà xuất bản y học. 2009.
9. Zhou Xiaoying, et al. Identification of the long non-coding RNA H19 in plasma as a novel biomarker for diagnosis of gastric cancer. 2015; 5(1), 11516.
10. Wang Wen-Tao, et al. Genome-wide long non-coding RNA analysis identified circulating LncRNAs as novel non-invasive diagnostic biomarkers for gynecological disease. 2016; 6(1):23343.