DỰ ĐOÁN in silico CÁC EPITOPE TẾ BÀO B CÓ TÍNH KHÁNG NGUYÊN TRÊN PROTEIN FepA CỦA VI KHUẨN Acinetobacter baumannii
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Mục tiêu: Xác định một số epitope tế bào B tiềm năng trên protein FepA có nguồn gốc từ vi khuẩn Acinetobacter baumannii (A. baumannii) nhằm phục vụ phát triển vaccine. Phương pháp nghiên cứu: Sử dụng các phân tích in silico để dự đoán tính kháng nguyên, tính tan, cấu trúc xuyên màng, các epitope tế bào B tuyến tính và lập thể của protein FepA, đồng thời đánh giá khả năng gây dị ứng, độc tính, các đặc tính lý hoá và mức độ tương đồng với protein người của các epitope. Kết quả: FepA được xác định là protein màng ngoài gồm 22 vùng xuyên màng kiểu β và có tính kháng nguyên cao. Nghiên cứu đã lựa chọn được những epitope tối ưu nhất của FepA, bao gồm 2 epitope tuyến tính (E3, E9) và 4 epitope lập thể (E12 - E15) có tiềm năng sinh miễn dịch cao và phù hợp cho phát triển vaccine. Kết luận: FepA là kháng nguyên giàu epitope, có giá trị trong phát triển vaccine phòng A. baumannii.
Từ khóa
Vi khuẩn A. baumannii, Protein FepA, Epitope tế bào B, In silico, Vaccine
Chi tiết bài viết
Tài liệu tham khảo
2. Lau YT, Tan HS. Acinetobacter baumannii subunit vaccines: Recent progress and challenges. Critical Reviews in Microbiology. 2024; 50(4):434-449.
3. Nemati Zargaran F, Akya A, Ghadiri K, Ranjbarian P, Rostamian M. Detecting the dominant T and B epitopes of Klebsiella pneumoniae Ferric Enterobactin protein (FepA) and introducing a single epitopic peptide as vaccine candidate. Int J Pept Res Ther. 2021; 27(4):2209-2221.
4. Subashchandrabose S, Smith S, DeOrnellas V et al. Acinetobacter baumannii genes required for bacterial survival during bloodstream infection. Blokesch M, ed. mSphere. 2016; 1(1):e00013-15.
5. Sun P, Guo S, Sun J, Tan L, Lu C, Ma Z. Advances in in-silico B-cell epitope prediction. CTMC. 2019; 19(2):105-115.
6. Rahman MdS, Biswas C, Biswas PK et al. In silico analysis of the antigenic properties of iron-regulated proteins against Neisseria meningitidis. Applied Sciences. 2020; 10(17):6113.